Hola,
No suelo usar modos semiautomáticos pero entiendo que te bajará la velocidad porque con la apertura que has elegido no tiene suficiente luz para exponer bien. Esa velocidad mínima que pones en la configuración del ISO automático, no es la velocidad mínima que va a usar para disparar sino que es la velocidad a partir de la cual va a ir subiendo el ISO hasta el valor máximo que has definido. Si llegas a ISO 6400 que es lo máximo que has definido y sigue sin poder exponer correctamente, no le queda otra que bajar la velocidad. Creo recordar que en estos casos te marca la velocidad en rojo o naranja para que te des cuenta que ha superado el límite e intentes arreglarlo si puedes usar un diafragma más abierto.
Un saludo