Yo tengo la X-pro1 y la X100S me parece que esta un poco más avanzada, por lo menos tecnológicamente que la X-pro1, es más nueva también, con el enfoque híbrido por contraste y fase, el focus peaking, enfoque partido, etc, etc. Es una compacta, pero realmente es (para mi gusto) la mejor compacta del mercado, la Sony RX1 es full frame, pero no lo veo determinante.
De todas maneras no entiendo mucho este afán de clasificar exactamente las cámaras.
La X-E1 no va a desaparecer, sino que además en breve aparecerá una XM-1 que será como la XE-1 pero sin visor electrónico, supongo que para ofrecer una gama baja a buen precio.