Y yo pensaba que te referías a modo TTL :-X
Siempre dispara en modo TTL, el hecho de que solo salte en automático en modo P me parece normal, viene a ser como el botón verde de las cámaras de aficionado. Con una réflex cualquiera en cualquier modo que no sea ese "verde" se supone que tú estás modificando los parámetros de toma para conseguir algo en concreto, y dentro de esos parámetros entra el de si quieres utilizar flash o no.
Imagina por ejemplo que estás haciendo fotos en un museo donde no se puede usar flash: tú tienes que decidir si sale el flash o no, no puede decidirlo la cámara por su cuenta. Si sale el flash siempre saldrá en modo "relleno", puedes variar su potencia a tu gusto.
A mí me parece normal, vaya. Cuando andaba con cámaras réflex y llevaba el falsh montado y encendido (igual que si lo llevas en la X-T1 y levantado) el flash se disparaba siempre - excepto en el modo verde de las cámaras de aficionado -.