Con la aparición de la versión 6.1 de LR, ha mejorado notablemente lo que LR obtiene de los RAF, acercándose así a otros productos, como C1, tal y como se explica aquí: https://fujistas.com/mejoras-en-el-soporte-al-sensor-x-trans-en-adobe-lightroom/
Por lo que si no quieres salir del mundo LR, parece que irá mejor.
Por cierto, en un RAW no hay ningún procesado previo (más allá de "picarescas" de los fabricantes para corregir problemas de sus ópticas y similares).
EDITO: sobre lo del manipulado de los RAW por lo fabricantes, véase
http://www.dslrmagazine.com/pruebas/pruebas-tecnicas/sobre-lo-crudo-y-lo-cocido.html